Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms