Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms