Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf3Q922U1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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