Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms