Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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