Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms