Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek8Q91ZR4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek8Q91ZR4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms