Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms