Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atpaf2Q91YY4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms