Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdhga12Q91XY7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdhga12Q91XY7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms