Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx15Q91WE1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx15Q91WE1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms