Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms