Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms