Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms