Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms