Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms