Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms