Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms