Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms