Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgef3Q8VCC8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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