Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApobrQ8VBT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms