Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RttnQ8R4Y8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms