Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms