Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K7

Snapc5, snRNA-activating protein complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc5Q8R2K7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snapc5Q8R2K7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snapc5Q8R2K7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms