Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CipcQ8R0W1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms