Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms