Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hoxc12Q8K5B8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hoxc12Q8K5B8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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