Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms