Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms