Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nsl1Q8K305 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms