Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms