Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms