Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh6Q8K2U2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh6Q8K2U2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms