Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Depp1Q8K2F3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms