Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms