Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek9Q8K1R7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms