Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh3Q8K1E6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms