Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scnm1Q8K136 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scnm1Q8K136 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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