Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms