Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrit1Q8K099 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms