Protein–RNA interactions for Protein: Q8K072

Reep4, Receptor expression-enhancing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep4Q8K072 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep4Q8K072 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep4Q8K072 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms