Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d5Q8JZW5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms