Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SbsnQ8CIT9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbsnQ8CIT9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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