Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms