Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp27Q8CEG8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp27Q8CEG8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms