Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc49a3Q8CE47 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc49a3Q8CE47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms