Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EfhbQ8CDU5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EfhbQ8CDU5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms