Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms