Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CD60 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CD60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q8CD60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CD60 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CD60 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8CD60 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms