Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riox2Q8CD15 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms